Träger der Grundschule Lütjensee ist der Schulverband Lütjensee. Diesem gehören die Gemeinden Lütjensee und Großensee an. Der Schulverband hat die Aufgabe die Grundschule Lütjensee nach den Vorschriften des Schulgesetzes zu errichten und zu unterhalten.

Der Schulverband wird durch die Schulverbandsversammlung vertreten. Dieser gehören an:

Geschichte des Schulverbandes

Im Laufe des Jahres 1978 entschieden sich die Gemeinden Lütjensee und Großensee die Trägerschaft der Grundschule Lütjensee in einem gemeinsamen Schulverband zu übernehmen. Um die Genehmigung durch den Kreis zu erhalten, musste eine Satzung beschlossen werden, dies geschah zeitgleich am 31. August 1978 um 20:00 Uhr in Lütjensee im „Seehof“ sowie in Großensee im Gasthof „Südstrand“. Am 15.11.1978 wurde schließlich ein Öffentlich-Rechtlicher Vertrag über die Errichtung eines Zweckverbandes „Schulverband Lütjensee“ geschlossen. Dieser trat dann am 1.Januar 1979 in Kraft. Der erste Schulverbandsvorsteher war Frau Christel Wendorff  aus Lütjensee, ihr Stellvertreter war Bruno Baumann aus Großensee. Die damalige Bürgermeister waren Herr Kähler für Lütjensee und Herr Hundsdörfer für Großensee.